博士宗像隆一郎在侦探方面很有建树,可谓奇葩一朵。突然,他的助手小池被人毒死了,并且留下了“三重漩涡”的怪指纹。H制糖股份有限公司董事川手连续收到匿名信,恫吓要杀掉自己的全家,川手被吓得不知所措,果然,当天,二小姐便失踪了,随后在U公园的科学陈列馆里发现了川手的二女儿的尸体,随后大女儿竟在众目睽睽之下,消失了……一连串的惨案和反复出现的“三重漩涡”怪指纹使川手精神崩溃了,为了逃难他随博士来到一个城堡里,在那里,他竟看到了几十年前的事情:自己的父亲在杀人!他终于明白了凶手为什么要杀自己全家。具有“三重旋涡”手指纹的人终于找到了,是一个娇弱的女子!她伙同哥哥疯狂制造复仇计划,在被博士抓获后自杀了,她哥哥也跳楼而死。案子似乎了结了……然而小五郎的出现和他大胆的行动使案子又颠倒了,宛如平静的海面上刮起了风暴……