一、經以今文二十八篇爲主，分爲四類：曰帝，曰三代，曰周公，曰四岳。諸書所引逸文，有可省併者省併之。篇目分合次序，博考古説，詳論於各篇之首。
一、國朝《尚書》之學最盛。王、孫以前無論矣，陳左海《先師遺説考》可云詳盡，但所録過於繁瑣，既經刊入《經解》，今取其精要者。至傳記中寔係《書》説而無明文者，暨非《尚書》先師，而説與經文切合者，陳氏漏於採入，今悉補之。凡陳本所有，不更注所出。
一、古、今之分，在禮制，不在文字。所有今、古文字異同，諸家已詳，非關要義者不録。今以禮制古説爲主，訓故之平易者及文異義同者，擇要録之。又事小而説繁，不能折中者，則不加解釋。如「六宗」及《禹貢》今地之類，若欲綜考，别有專書。
一、古學以訓故爲主，今學以師説爲主。訓故可以望文，師説必須傳授，此今、古難易之分。今採説義取先秦以前者十之六七，漢以後不過二三，晉以下不用博士説。不必本經先師，乃用馬、鄭説，不關今、古異同者，擇要録之。
一、六經各立門户，《經解》及《莊》、《荀》以下所言各經學教不同，今附《綱領》一卷，詳論其事。至於制度、事蹟與各經相同者，采取經文爲證，詳其沿革變通。《戴記》、《左》、《國》師説之古者采之尤詳。
一、古學以《周禮》爲主，《周禮》與經大綱制度不同，馬、鄭强經文以合《周禮》，皆爲誤説。經只二十八篇，百篇《序》乃古學，摭拾張霸《百兩篇》而成，并以羼入《史記》。今别撰《古學證誤》二卷，專明《書序》、馬、鄭及今文二十八篇不全之誤説。
一、荀子以周公、仲尼爲大儒者，《尚書》師説也。《尚書》詳於周公，略於文武成康，儼然以周公自成一代，與王魯元聖諸説相通。今取《繹史》、《古史拾遺》周公事蹟以注之。《金縢》爲總序，五《誥》爲正篇，以下五篇爲分篇，用史説以分先後。自孔孟以下，以周公爲天子及攝政事蹟皆附焉。
一、《尚書》以二帝、三王、二伯爲主，别撰《帝王伯表》一卷。凡諸書言帝、王、伯升降及事迹不同之説，皆附之。
一、《尚書》備四代之文，所有各書言四代三代禮制文質異同者，皆《尚書》專説。舊有《四代禮制異同表》稿本，再加補證，編爲一卷。
一、《尚書》有禮制、行事之分。如《帝典》、《禹貢》、《咎繇謨》、《顧命》及四《誓》之類，典禮制度皆與諸經相通，故文義明白。至於諸誥雜有方言古語，故語多不可解。又其中篇目分合多脱誤，能考訂者説之，餘則從略。
一、《尚書》皆自有序，無序者爲分篇，不必如《書序》再加序也。總核分合共二十八篇，分爲四類，於各類之首列其篇目，詳考其分合。所有各篇大綱宗旨，亦採古説附之。僞古文不能廢，又多本於古書，今悉取以附於各條之下，如《左傳》引《書》説以解經也。
一、《尚書》與各經互文見義，制度、行事二十八篇已足，此孔子删定經本也。古書尚多，不廢傳習。諸書所引佚文，有爲今文傳説者，有隱括經文句者，又有非《書》誤以爲《書》者。至於《泰誓》、《武成 注 》之類，則爲古書，所謂孔子所删之篇。張霸取爲《百兩篇》，東晉本因之别撰二十五篇，皆誤也。《史記》中羼有《序》文，今附録全用史文，僞《序》各辨於本條之下。
一、帝四篇《堯典》、《禹貢》、《咎繇謨》、《洪範》附焉，依《大傳》之次。三代夏《禹誓》一篇，殷《湯誓》、《盤庚》、《高宗肜 注 日》、《西伯戡黎》、《微子》合一篇，共五篇。周《牧誓》、《顧命》二篇，從成康而止。凡傳説言文武成康者，皆《尚書》專説，悉取以附於《顧命》、《康王之誥》篇目之下。
一、《書》政事制度，《帝典》盡之矣。而行事得失，則詳於《洪範》，《洪範》又爲全《書》之綱領。今據《洪範》作表，如五福、六極《書》中言及者皆依類鈔之。如《無佚》言先王長壽短札、「永保休命」、「勦絶其命」之類，又如「三德」、 總數。 「峻德」爲天子，「九德」爲三公，「六德」爲諸侯，「三德」爲大夫。凡經中言德者，皆彙鈔爲表，據此推之。
一、書者，如也，略如史。説經尤貴事明，今取《大戴禮》、《周書》爲主，附以《史記》三帝三王世事實，各附本篇之末。始二帝，終成康，成康以下則詳於《詩》矣，列國、封國則詳之。由《書》而《詩》，由《詩》而《春秋》，本末詳備。
一、四岳篇以「王曰」、「公曰」分爲二類四篇，《文侯之命》與《吕刑》南北相比爲一類，既爲岳，又爲周之二伯。《費誓》、《秦誓》二「公曰」以屬周公焉。 四篇無序，即以爲分篇亦可。
一、《尚書》經也，傳記篇章佚在各書，舊失採入。如《五帝姓》、《明堂位》、《作雒》、《文王官人》之類，是或佚在《禮記》、《周書》，或佚存先秦師説中。今并收入五十餘篇，以爲完璧，仿《左傳》先經後經之例。
〔附〕今文尚書二十八篇序例 以二帝、三王、周公、四岳爲綱。
帝篇四 次序從《大傳》「七觀」。
帝典 君道。包括全書，以下二十七篇略如傳説，皆以發明此篇之義。
禹貢 《帝典》分篇，詳禹爲司空事，故文見於《典》、《謨》。
皋陶謨 臣道。謨，猶摹也。發明《帝典》之義，如傳之於經。
洪範 範，謨範也。包君臣言之，帝堯舜也，禹夏也，箕子殷也，武王周也。此篇兼二帝三王言之，言義不言事，爲全書之總例，故《大傳》附之《典》、《謨》後。
三代篇八 五言三王三，二伯二，各有分屬，不重見。
夏 禹誓 夏禹見誓一篇，明天子出征之制。
殷 湯誓 殷、周各見一誓，蓋以征誅得天下。
盤庚 殷中興。
高宗肜日 注 殷再興，《孟子》云「賢聖之君六七作」是也。録盤庚、高宗二君，與周録成、康相起。
殷周之際 西伯戡黎 注 、微子
周 牧誓 三代各録誓一篇，武王伐紂事，經只一篇，餘皆傳。
顧命 成、康相繼，即「受終文祖」之詳文也。周道盛於成、康，故録《周書》至成、康而止。
周公篇十二 《書》略於三代，詳於周公，以周公爲主。周公爲一代，以元聖、素王相起，故獨詳之。○周公似舜，舜攝堯之天下，而讓之禹，周公攝武王之天下，而讓之成王。
金縢 此周公總序，以下十一篇皆其細耳。較之《帝典》具體而微，其文詳略互見。《金縢》所不詳，當於《帝典》中求之。
大誥 五誓分説王伯，五誥則全爲周公書。《孟子》「周公思兼三王，以施四事」，一人兼王伯，故《誥》與《誓》數目相敵也。
康誥
酒誥
多方 周公書當以五誥篇名爲正，凡此之類，皆五誥分篇子目。
梓材
召誥
君奭
多士
雒誥 五誥皆言中州王畿，與下四岳相起。
無逸
立政
二伯篇四 《顧命》最詳二伯四岳之制，故以伯繼王。○《費誓》東岳，《文侯之命》北岳，《甫刑》南岳，《秦誓》西岳。
甫刑 《謨》：「天命有德，五服五彰；天討有罪，五刑五用。」命、刑對文。
文侯之命 以上二篇皆王命。
費誓 以下二篇皆「公曰」，此二誓與三代誓共五篇。
秦誓 四篇以「王曰」、「公曰」分爲東、西、南、北，相對成文，兼舉則爲四岳，單稱則爲兩伯。
注 武成：原作「武城」，誤。據《尚書》改。
注 肜：原作「彤」，誤。據《尚書》改。
注 高宗肜日：「肜」原作「彤」，據《尚書》篇名改。
注 西伯戡黎：「戡」原作「之」，據《尚書》篇名改。