明神宗万历元年（一五七三）：初，俞大猷移镇福建福、兴、泉、漳、延、建、邵武、福宁并浙江金、温地方。方议攻贼澎湖，忽有新倭自漳、泉趋福宁，大猷遣兵追之；将及，副将邓之屏促向澎湖，新倭猝入烽火寨，杀把总去（名山藏俞大猷传）。
八年（一五八○）九月，日本犯浙江韭山及福建澎湖东涌（明史）。
三十二年（一六○四）七月，福建人李锦、潘秀、郭震久居大泥，与和兰人习。其酋麻韦郎欲通贡市，锦为画策，夺澎湖屿而守之；因贿高寀，使上请于天子。酋善之，锦乃为大泥国王书移寀及守将，俾秀、震赍以来。守将陶拱圣大骇，白当事，系秀于狱；震不敢入。而酋已驾三大艘直抵澎湖，伐木筑舍，为久居计。锦亦潜入漳州侦探，当事亦系之狱。已乃令三人谕其酋还国，将校詹献忠持檄与俱。献忠多携币帛食物，觊酋厚酬。锦等又依违其词，酋不肯去。采已遣人索贿三万金，许为代奏。会都司沈有容自请往谕。有容负胆智，大声论说。其下人露刃相诘，有容盛气与辩，无所慑。酋心折，乃曰：『我从不闻此言』。时巡抚徐学聚严禁奸民下海，犯者必诛；接济路穷，酋无所得食，即索取所予寀金，扬帆去。锦等皆伏罪（明纪）。
四十七年（一六一九）四月，漳州府奸民李新僭号「洪武」，结海寇袁八老等率兵党千余人流劫焚毁，势甚猖獗。巡抚王士昌檄副将纪元宪、沈有容等领兵讨平之（通鉴纲目三编）。
熹宗天启五年（一六二五）九月，海贼刘香寇福建（明史）。
七年（一六二七）六月，海寇郑芝龙等犯福建铜山、中左所等处（明史纪事本末）。
怀宗崇祯元年（一六二八）正月，工科给事颜继祖劾福建总兵俞咨皋下狱。初，巡抚朱钦相招抚海寇杨六、杨七等；郑芝龙求返内地，杨六绐其金，不为通，遂流劫海上。继祖上言：『海盗郑芝龙生长于泉，聚徒数万，劫富施贫，民不畏官而畏盗。总兵俞咨皋招抚之议，实饱贼囊。旧抚朱钦相听其收海盗杨六、杨七以为用，而咨皋招之海即置之海，今日受抚，明日为寇。昨岁中左所之变，杨六、杨七杳然无踪，咨皋始缩舌无辞，故闽帅不可不去也』。疏入，逮咨皋下于理（明史纪事本末）。
三月，禁漳、泉人贩海。芝龙掠福建、浙江海上（明史纪事本末）。
七月，兵部议招海盗郑芝龙。九月，芝龙降于巡抚熊文灿。工科给事颜继祖言『芝龙既降，当责其报效』。从之。初，俞咨皋招杨六、杨七降，独芝龙猖獗如故。芝龙败都司洪先春，释不追；获一游击，不杀；咨皋战败，纵之走。当事知其可抚，遣使谕之。癸未，芝龙降。会朝命布政使熊文灿为巡抚，文灿善遇芝龙，使为己用：先后击擒李魁奇，蹙锺斌于大洋投海死，海警遂息（明史纪事本末、明纪）。
二年（一六二九）二月，海盗李魁奇伏诛。魁奇本郑芝龙同党，芝龙忌之，击斩粤中。
四月，广东副总兵陈廷对约郑芝龙剿盗。芝龙战不利，归闽。不数日，寇大至，犯中左所近港；芝龙又败，寇夜薄中左所（以上明史纪事本末）。
七月末，吉了警至，人心奔溃。当事汲汲图近守之策；有以专守闽安镇为言者，以此镇最狭，可设铳墙、设木牌也（崇相集）。
三年（一六三○），红夷据澎湖，犯漳、海澄、中左所，入厦门（蔡忠烈年谱）。
四年（一六三一）正月，上召廷臣及各省监司于平台，问福建布政使吴杨、陆之祺备御海寇之策（明史纪事本末）。
平远贼锺凌秀与弟复秀聚千众于连子山铜鼓嶂。
二月，贼掠永平寨，杀官军二百有奇，守备、千百户、把总皆死。旋札黄峰隘，知府林联绶调兵御之；指挥严明被执，千户刘尧、百户张机不屈死。
贼突出瑞金县，札南门冈，为乡豪张振熙、僧守贞所败；尽弃辎重，徒手趋还杨家巷。林守惩前败，不发兵堵截。贼复收残孽，整队而出。官兵御之，指挥王应官、张大伦、把总王国佐、赖思养、赖君迁、曹纬咸败死。次日，巡道顾元镜复遣指挥韦某、百户张耀接援。韦闻败先窜，张战死。
九月，督抚熊文灿提兵入汀会剿。时贼舍杭武，径出广东，袭始兴县，破之；羽书告急。奉旨，谕熊会赣、广两院合剿。熊乃率郑芝龙亲兵驻上杭。
十月，参将郑芝龙师驻三河坝，督官兵捣贼巢；遇贼于丙村，斩馘三百余人。次日，贼迎战，又斩贼三百余级。陈二总乞降，不许，并斩之，焚其巢而还。
五年（一六三二），郑芝龙追贼至石窟都。锺凌秀以贼二百受抚。
二月，锺凌秀弟复秀叛，招余党三百余，焚掠蓝屋驿；复由渌水潭至回龙冈，焚劫甚酷。巡道顾元镜遣百户赖其勋等御之，战死。谢志良追兵亦至，战败，死者百人。赖明照亦陷阵死。
四月，顾元镜自上杭率千总刘良机、材官郭之英、陈望正、把总黄基昌、蔡联芳等往雩都、兴国，会郑芝龙兵大剿。
八月，顾元镜同总兵陈廷对、同知黄色中屯程乡，捣贼巢（以上临江汇考）。
九月，海盗刘香老（一但作香）寇福建，巡抚都御史邹维琏遣游击郑芝龙击破之（明纪）。
十一月，海盗刘香老犯小埕，游击郑芝龙击走之。
六年（一六三三）六月，海盗刘香老犯长乐（以上明鉴会纂）。
红夷袭陷厦门城，大掠。邹维琏急发兵水陆并进，参政曾樱请用郑芝龙为军锋。芝龙焚其三舟，官军伤亦众。寇乃泛舟大洋，转掠青港、荆屿、石湾。巡抚御史路振飞悬千金励将士；诸将御之铜山，连战数日始败去（明纪）。
七年（一六三四）四月，先是锺凌秀既降复叛，为郑芝龙所擒；其党溃入长汀，转掠江西属邑，芝龙屡败贼。会福建有红夷之患，刘香乘之，连犯闽、广沿海邑。总督两广侍郎熊文灿不能讨，议招怃。漳州知府施邦曜絷香母以诱贼，贼阳许之；乃令参政洪云蒸、副使康承祖，参将夏之本、张一杰入贼舟宣谕，云蒸等俱被执。文灿惧罪，奏诸臣信贼自陷。给事中朱国栋效之，帝令戴罪自效（明纪）。
八年（一六三五）四月，福建游击郑芝龙合粤兵击刘香老于田尾远洋。刘胁被执兵备道洪云蒸出船止兵；大呼曰：『我矢死报国，亟击勿失』！遂遇害。香老势蹙，自焚溺死。康承祖、夏之本、张一杰脱归。八月，香老家属六十余人、部属千余人至黄华降于温处参军（明史纪事本末）。
十三年（一六四○）八月，加福建参将郑芝龙署总兵。芝龙既俘刘香老，海氛颇息；又以海利交通朝贵，浸以大显（明史纪事本末）。
十七年（一六四四）三月，督抚张肯堂移镇漳州。初，十五、六年间，南安、仙游之贼啸聚日繁。既而漳南群盗复起：梁良、赖禄之徒攻城围邑，驰骤于龙岩、漳平、永定、平和之间，西及汀、赣；崔鹰、锺亮、华祝、方安之徒奔轶破撅。至是，将军郑芝龙请先趋云霄取叶、方，廓清浦南之道；然后回戈，西取梁、赖，南并崔、锺，使上下援绝。肯堂不从；请芝龙西扼南靖，断梁、赖之道，出别将取叶、方。郑既趋南靖，塞山城、五峰诸口，梁、赖诸部皆不得反里舍。别遣洪中军出云霄。时方久雨，叶、方日侦师期，将南走并于崔、锺。郑已先遣施中军西走间道，出大埔、普宁，云将捣崔、锺，阴遣人豢叶、方，使诣降自赎。叶、方相顾，正赵趄间，诸部落已渐散去。方安跳身就系；叶祝率数百众将从崔鹰，遂为施中军所得。于是洪中军亦出石梯岭，搜诸洞，擒获诸部首，而浦南道清。时梁、赖西去围永定，又进围龙岩、漳平，焚掠横甚。郑欲西上角逐，肯堂不从。亡何，诸贼党苦野次失其巢穴，不得越南靖，时时就郑请命。郑亦佯宽之曰：『尔稔毒势不俱全，能有所诛夷，自效可耳』。未几，梁、赖有隙。梁良见势绌，暴死。赖禄欲自拔，率数千人求见郑。郑顾部将当阵擒之，俘馘数千，诸大脑以七宿着号者各反手就缚。不数日，崔鹰亦败。施中军所俘馘称是，生得崔鹰。先后破除诸盗贼十百起，近不踰旬朔、远不过岁时；所用军储不过万余耳（黄漳浦集）。
四月，按院陆清源出牌云：『照得谋国不臧，贼遗君父，正主忧臣死之日』云云。人见之愕然。盖煤山之变，已有密探也（榕城纪闻）。
八月，封郑芝龙安南伯。
十月，以郑芝龙为总兵官，镇守福建等处（以上甲申日记）。
福王弘光元年（一六四五）二月，芝山灵源阁灾。旧谶有云：『火烧灵源阁，三山作战场』；邑人大惧。闽中自此不靖矣（榕城纪闻）。
五月，清使江南御史黄熙胤招抚福建。熙胤，晋江人，与郑芝龙同里。芝龙密遣使通款（三藩纪事本末）。
六月，唐王监国福京，闰月即皇帝位（甲申日记作七月），以七月以后为隆武元年。唐王名聿键，小字长寿，太祖子唐定王桱之后。崇祯五年袭位，年三十一矣。九年秋八月，京师戒严，王率护军勤王，汝南道周以兴制之不听。至裕州，巡按御史杨绳武以闻，旨下切责；下部议，废为庶人，安置凤阳高墙。十七年三月北都陷，南京福王立，改元弘光，以明年为元年；唐王赦出高墙，礼臣请复王爵不许。十一月，命徙驻广西之平乐府。明年（即弘光元年）五月，行抵杭州，而南都已覆。王劝潞王监国，不听。时镇江总兵郑鸿逵、户部侍郎何楷、户部郎中苏观生胥会于杭，遂奉王入闽。六月甲戌，次浦城。闰六月癸未，福建各官迎谒于水口驿。南安伯郑芝龙、礼部尚书黄道周、福建巡抚张肯堂、巡抚御史吴春枝等三笺劝进，王出御用银一百五十两令有司葺行宫，勿扰民。丁亥，至福州监国，建行在太庙、社稷。时郑芝龙拥兵骄悍，鸿逵欲王早正位以系人心，芝龙犹豫弗决。群臣多言监国名正，建号宜迟；不报。十五日，祭告天地祖宗，即位南郊，以福建为福京、福州为天兴府、布政司为行殿、福州府为国子监；大赦，称号隆武。追尊皇考为皇帝、妣为皇后，遥上福王尊号曰圣安皇帝。鸿逵封定虏侯，寻晋定国公；芝龙封平虏侯，寻晋平国公；其弟芝豹封澄济伯，郑彩永胜伯；并赐号奉天翊运中兴宣力定难守正功臣。芝龙部将施天福武毅伯、洪旭忠振伯、林习山忠定伯、张进忠匡伯、陈辉忠靖伯，鸿逵部将陈豹忠勇侯、林察辅明侯。以黄道周为吏部尚书武英殿大学士，苏观生为吏部右侍郎兼东阁大学士，福建巡抚张肯堂为兵部尚书兼左都御史，何楷为户部尚书，四川按察使曹学佺为礼部尚书兼兰台馆学士，福建巡按御史吴春枝为兵部右侍郎兼右副都御史，周应期为刑部尚书，郑瑄为工部尚书，黄锦为礼部右侍郎。闽设八巡抚。何吾驺、蒋德璟、黄景昉、朱继祚、林欲楫、姜曰广、吴甡、高弘图、路振飞、曾樱、郑三俊、熊开元、黄鸣俊、顾锡畴、陈子壮、林增志、李先春、陈洪谧、王锡衮、陈奇瑜等，皆遥授阁辅，戎车转侧至者数人。林增志、李先春先至，同入阁办事；然不令票旨，皆王亲为之。王性素俭，少遭患难；既即位，慨然以复仇雪耻为务，布衣蔬食，不御酒肉。敕司礼监：行宫不以金玉玩好陈设，器用磁锡；帏幄被褥皆布帛，绝无锦绣。后宫无嫔妃，御执事者三十人而已。中宫懿旨选女厨十人，王闻之，以为扰民，不许。勤于听政，批阅章奏，丙夜不休。上书陈言军国大事者，辄以手诏答之。素好读书，博通典故，手撰三诏与鲁监国书，群臣皆莫能及。重风节，重文学；收召名士，不次擢用。其志欲大有为于天下，而阨于时势。感路振飞旧恩，募能致者赏千金，给五品秩（残明宰辅年表、南疆绎史、明纪、清白士集、海上见闻录、榕城纪闻、三藩纪事本末、小腆纪年）。
六月，浙东张国维、朱大典、孙嘉绩、方逢年等迎鲁王监国绍兴。时浙西已降附，清兵方在江楚；吏部侍郎杨廷麟、兵部侍郎万元吉、国子祭酒刘同升等以义师往来捍御，克复吉安、临江等处。遂加廷麟兵部尚书兼东阁大学士，赐剑便宜从事；元吉副都御史，总督江西、湖广诸军；以同升为南赣巡抚。时唐王优礼郑氏，以闽事属之ｏ芝龙长子森入见，奇其表，赐国姓，改名成功，命提督禁旅，以驸马都尉体制从事。芝龙议陈战守事宜，自仙霞关外当守者计百余处，应设守兵若干。其战兵以今冬简练，明春出关，一出浙东、一出江右，计兵二十余万。合闽、粤饷不支一年，仍请于两税正供内米一石预借银一两，令群臣捐俸，劝绅士输助，察府县历年积榖银两未解者悉催赴行在，遣侍郎科道征发。吏部主事王兆熊兼御史督御饷急迫，不输者，榜其门曰「不义」；于是闾里骚然矣。芝龙又请清理寺田，可得饷八十万，王不听。户部侍郎李长蒨请广开事例，从之。无论厮养隶卒，皆得给札授官。犹苦饷不足，守关兵仅数百人，率疲癃不堪用。设储贤馆，定十二科取士，以苏观生领之；已而招徕者多挟邪士，王亦厌罢。王以盗贼之兴，皆由贪吏虐民，欲效高皇帝之法惩之。建阳知县沈■〈火豦〉贪酷被劾，特敕诛之，辅臣申救，不听；由是人稍知惧。廷臣日请出关，王屡戒征期，芝龙辄以饷绌为辞。会赐宴大臣，芝龙自以侯爵欲位首辅上，黄道周争以祖制武职无班文臣右者，终先道周，芝龙鞅鞅不悦。道周知芝龙无意视师，乃自请出关，号召义旅，且藉以联何腾蛟图恢复；王许之。请兵请饷，芝龙皆不应，仅给羸卒千人，赉一月饷，赍空敕数百道而行。时七月辛未也（南疆绎史、清史纪事本末、海上见闻录、小腆纪年）。
唐王隆武元年（一六四五）八月，幸大学。乙酉，颁祖训五十七条于阁部科道，大学士林欲楫率诸臣表谢。庚寅，命肃卤伯黄斌卿出镇舟山。命吴江诸生孙文中赍手敕召路振飞；及其至，拜太子太保、吏兵二部尚书、文渊阁大学士，官其子太平为兵部员外郎。壬辰，册曾妃为后，赠后父曾文彦为吉水伯。癸巳，行郊天礼于南郊，芝龙、鸿逵称疾不从，户部尚书何楷劾其无人臣礼，宜正厥罪；王喜楷敢言，命掌都察院事。命妇朝后于太和殿。邵武知府吴炆炜、推官朱健闻敌畏葸，弃城先逃，下狱诛。靖江王嘉亨僭号桂林，执巡抚瞿式耜幽之，两广总督丁魁楚遣总兵陈邦传往攻；封魁楚平粤伯，加式耜兵部侍郎。式耜得释，即令中军焦琏合邦传兵擒之，械送福州。行保甲法于天兴府。定锦衣卫军制，设中前后五所，每军百户曰一威所，八威所为一禁军。时兵事皆掌于郑氏，芝龙自知众论不平，不出关无以弭众，乃请以鸿逵为大元帅出浙东、彩为副元帅出江西；各拥兵数千，号数万。既出关，托候饷，仍驻不行。鸿逵驻仙阳镇，虑有上书言事者，严禁仙霞关不听四方儒人入。王檄催孔亟，不应。彩行百里而还，称饷缺，留如故。
九月，清兵取徽州。时李自成兵败，走九宫山，为村民鉏击以死，楚督何腾蛟以闻。其众无所归，推其兄子李锦为主，同自成后妻高氏、高弟一功等乞降；腾蛟与摄抚堵胤锡往受之，一时增兵数十万。王大喜告庙，进腾蛟大学士，封定兴伯；胤锡右副都御史，实授湖北巡抚，总制其军。降将皆授总兵官；赐李锦名赤心、一功名必正，高氏为贞义夫人，号其营为忠贞营。已而粮不继，降者稍稍散去。高氏十三部就食施州卫，其余郝摇旗、马进忠、王进才、张光翠、袁应第、牛万才、张先璧等十余营悉隶腾蛟麾下，军势颇振。然王内制于郑氏，不能出关相应援也（以上南疆绎史、榕城纪闻）。
十月，科臣刘中藻颁谕浙东鲁王，不受，张国维、熊汝霖等拒之也；自是闽、浙相水火矣。鲁行人张煌言自请使闽，从之。原任兵部侍中王期升、御史彭遇颽至行在，加期升总督衔、遇颽佥都御史。大学士路振飞、曾樱封还内传，谓遇颽依附马士英，期升在太湖奉朱盛征称通城王，派饷苛虐，不可用；王乃止。杨廷麟疏至，请王幸江右；何腾蛟请驻湖南，浙中诸将请如衢州。王以芝龙不足恃，欲出赣入楚倚腾蛟。会原任临清知州金堡朝行在，言腾蛟可倚，急宜弃闽幸楚；王大喜，即擢堡兵科给事中，决计由赣以赴长沙。遣大学士苏观生诣南安募兵。户部尚书何楷请告去。相传楷与芝龙不合去，至大田驿，忽夜数十人排户擒殴，去其左耳，未几死之（南疆绎史、小腆纪年、海东逸史、榕城纪闻）。
十一月甲午，类于上帝，以钓龙台为天坛。乙未，禋于太庙。丙午，禡于社稷。丁巳，以郑鸿逵为御营左先锋出浙江、郑彩为御营右先锋出江西，驾幸西郊行推毂礼。先期为坛，设先帝高皇帝位。王御翼善冠诣坛所，百官陪位，武臣戎服听事。王皮弁升坛拜谒，立于神位西、南面，御营先锋北西跪，兵部授钺，王东向揖之。赐饯，光禄寺授爵，御营先锋跪受爵。诫劳毕，谢恩出，率将士跪坛下。王甲冑誓师，乃鸣金鼓扬旌而出。当授钺时，风雨晦冥，大风陡起，坛上烛尽灭，神位皆仆；鸿逵出城，马蹶踣地，
者以为不祥。下诏亲行，以唐王聿钊、邓王鼎器监国，大学士曾樱协同芝龙留守。以吴震文为随营兵部侍郎、王觐光为随营户部侍郎，皆兼吏户礼三部事；张家玉、陈履贞为随营兵科，亦兼吏户礼三科事。命曹学佺修思宗实录，设兰台馆以处之（同上）。
清授张存仁浙江福建总督（贰臣传）。
十二月甲申，王戎服登舟，大学士何吾驺等随行。舟次芋江，五溪百姓壶浆迎者载道，皆赉以银牌。清佟养和、金声桓进剿福建，分兵攻南赣，败永宁王、罗川王、阁部黄道周等。壬寅，道周师至婺源溃，被执。南赣巡抚刘同升卒，命万元吉兼摄其事（南疆绎史、清世祖实录）。
是年，清遣内院洪承畴招抚江南、御史黄熙胤招抚福建，皆芝龙乡人（三藩纪事本末）。
二年（一六四六）正月己酉朔，唐王在建宁，不受朝贺，以三大罪自责，令百官皆戴罪从行。交趾、日本国皆遣使入贡。广东布政使汤来贺运饷十万由海道至，擢来贺户部右侍郎。马士英叩关求入朝，王数其罪，谕守关将士勿纳；士英七疏自理，终不许。鲁监国遣柯夏卿、曹维才来聘，王加夏卿兵部尚书、维才光禄寺少卿，手敕谓：『朕无子，王为皇太侄，同心戮力，共拜孝陵。朕有祚士，终致于王。取浙东所用职官，同列朝籍，不分彼此』。寻遣佥都御史陆清源解饷十万犒浙东江防诸军，而浙中相传闽遣黄鸣骏来科浙中八府粮，盖士英、阮大铖构之也。方国安纵兵夺饷，杀清源（案系三月事），而闽、浙衅益深矣。熊开元罢，以苏观生兼吏兵二部尚书行在文渊阁大学士，出为经略，赐上方剑便宜行事；王御门，赐银印日「瞻奉南北山陵安集军民文武官」。召见泉州方士蔡鼎，授为军师（南疆绎史、海东逸史、小腆纪年）。
二月，马胫岭兵变，命路振飞至浦城安抚之。江楚迎王疏相继至。诏宽逆案之禁，王曰：『北京陷于东林、南都亡于魏党，厥罪维均。今中兴之初，嘉运綦新，附党诸臣，概予洗濯，以收后效』。擢堵胤锡右副都御史，巡抚湖广。丁亥，大雨雹，风霾昼黑，对面不相见。广西有僧自称弘光，召九乡科道议将迎请，廷臣曰：『即真弘光，甫经失国，有尊奉而无迎请』。已而有司审知其伪，下狱诛之。嘉亨俘至，下诸王议，废为庶人，以幽死；诛其臣顾奕、吴之琮、杨国威、张龙翼等（同上）。
太子少保、户部尚书、文渊阁大学士蒋德璟罢（残明宰相年表）。
柱国少保、吏部尚书兼文渊阁大学士路振飞赴浦城安抚兵变；七月督师安关，八月走泉州（同上）。
三月戊申朔，督师大学士黄道周殉节南京；王闻恸哭，辍朝，赠文明伯。王将出汀入赣，与湖南为声援；芝龙使军民数万人遮道号呼，拥驾不得行。芝龙因具表请回天兴，王不得已驻札延平。封成功为忠孝伯，挂招讨大将军印。以张肯堂为留守，旋加少保，总制浙直，给敕印便宜从事。辛未，清兵破吉安，郑彩弃广信，奔入关。
四月五日万寿节，不受贺。未几，抚州亦破。命礼臣追复建文年号，立方孝孺祠。先是，汀邵间有大帽山峒蛮最强，屡征不服，益宗永宁王慈炎诱之出降，以与清兵战屡捷，遂复抚州；清兵围之。郑彩屯广信府，永宁王请救；其监军给事中张家玉以三营往援，围暂解。已而复合，彩军溃，抚州遂破；永宁王死之，峒峦亦散。报至，举朝震惊，命削彩职，戴罪图功。廷麟、元吉退守赣州，清兵追攻之。
五月竞渡，郑芝龙率标营官军于西湖斗舟，旗帜皆写「钦命藩王」等目。
琉球国入贡。廷试贡生，取万刑等十二人，命为萃士，照庶吉士例送翰林院教习。擢湖广监军道章旷为右佥都御史，巡抚湖北。鲁监国遣都督陈谦入闽，久驻衢州持两端，自云鲁已爵为侯，却邀封。召赴行在，御史钱邦芑劾其外媾，下狱，将杀之。芝龙与谦有旧，亟入朝，请以官赎谦死；王故留芝龙久语，密促行刑。芝龙出，已死矣，因厚殓之；由是益怀异志。加吏部尚书郭维经六省督师衔，募兵援赣。赣已被围两月，巡抚刘广胤战败受执，援兵皆不敢前。
六月，开科取士。命广额七十名，流寓者皆入试。以编修刘以修、闵肃为主考，举叶琐等一百七十五名。士子多以贿进，乃命于至公堂覆试，落四名；逮同考推官王三俊下狱，追赃一万两。浙东报至，清兵已渡江取绍兴，鲁监国航海去，江上诸师尽溃。鸿逵驻城外，闻报，乃徒跣而逃，三日抵浦城。事闻，行在大震，削其封爵（以上南疆绎史、小腆纪年、榕城纪闻）。
鲁王航海入闽，十二月次中左所，寻改次长垣。
兵部尚书东阁大学士田仰奔闽，封海忠伯；寻迎降。
兵部尚书兼东阁大学士督师防江熊汝霖随扈鲁王入闽（以上残明宰辅年表）。
七月，元子生，大赦；加恩从兴诸臣，悉进爵。御史钱邦芑言：『浙东新破，唇亡齿寒，举朝正切同仇之日，非蒙恩受赏时也』。不报。己已，王御门，内侍捧小匣置御前，诏谕群臣曰：『朕本无利天下心，以勋辅拥戴，不得已勉徇群策，浣衣粝食，有何人君之乐？干夕干惕，恐负重付。岂意诸臣已变初志！昨巡闽之使，得尔等出关迎降书二百余封，今俱在此。朕不欲知其姓名也，今命锦衣卫焚之午门前。尔诸臣其有名者，尚洗心涤虑否？倘能竭节奉公，不渝终始，是所望也』！王长身丰颐，声如洪钟，闻者悚息。时决计幸赣，芝龙百计阻之，欲留王以自重；既而阴通款于洪承畴，托言海寇至，驰还临安，尽撤关隘，水陆诸兵随之去。清兵既破浙东，长驱而前，仙霞岭空无一卒，遂如入无人之境焉。何腾蚊遣郝永忠以铁骑五千迎驾，将至韶州，清兵已出衢州矣。初，杨文骢走处州，唐王与之有旧，拜为兵部侍郎，提督军务；至是援衢，清兵至，不能御，为追骑所获，不降，戮死（南疆绎史、通鉴辑览）。
八月甲申，清兵克建宁，明兵备佥事倪懋熹死之（小腆纪年）。
甲午，王启行。监军钱邦芑先期请清路，犹赫赫颐指属县。乙未，驾至行宫，戎冠金蟒而入。上好书，虽崎岖军旅，犹载书数十车以从。丁酉，上抵顺昌，昧爽未发，至巳刻，一时排闼，云清兵已及剑津，毁关，且踵至。顷之，行宫数骑突出，云驾已在内，从行者惟何吾驺、郭维经、朱继祚。已而何与郭亦散去。曾后肩舆河干，顾从官曰：『刘宫人有怀，好护持就道』；辞旨慷慨。妃媵狂奔，有一舸而数人者，有一骑而三人者。先是清兵抵仙霞关，守浦城巡按御史郑为虹纵民出走，自守空城，与治饷兵科给事黄大鹏、延平知府王士和并被执，死之。至是，王自延平出奔。庚子，入汀州城。辛丑，清兵奄至，有叩城称扈跸者；开丽春门纳之，则追者八十三骑也。守门百户闵时死之，骑直入行宫，从官迸散，乃执王与曾妃去。总兵福清伯周之藩战死。妃至九龙潭投水死，沈嫔、陈嫔及内官死者十余人。王死于福州（三藩纪事本末、小腆纪年作王与曾妃同斩于汀州之府堂）。其殉难之臣有唐王聿钊与弟聿■〈金粤〉、部郎赖垓、给事中熊纬、御营总兵胡上琛、定远侯邓文昌等。或曰代死者为张致远，王实未死；后郑成功兵屯鼓浪屿，有遣使存问诸臣者云为僧于五指山，然亦莫必其真伪也。是冬十月，赣州闻王讣，全城气索。会天雾雨雪，城夜破，督师大学士兵部尚书杨廷麟、户部尚书姜一洪、兵部侍郎左副都御史江广总督万元吉俱赴水死，吏部尚书郭维经、御史姚奇胤入嵯峨寺自焚死，湖西兵备佥事太常卿彭期生自缢死，兵部职方主事周瑚被执不屈戮之，右都御史杨文荐擒至南昌绝粒死，翰林院编修徐复仪投崖死。后闻难继死者：尚书曹学佺、通政使马思礼等皆自缢，御史艾南英缢于汀州僧舍，大学士蒋德璟于九月泉州失守不食死。粤中永明王立，遥上尊号曰思文皇帝。丁酉春，复谥曰绍宗襄皇帝（闽事纪略、南疆绎史、清白士集、临汀汇考、小腆纪年、恽逊庵遗集）。
时大学士何吾驺走广州，十二月迎降。大学士曾樱、路振飞走居中左所。大学士黄景昉走泉州。大学士朱继祚走兴化。吕大器奔广东。熊开元为僧。太仆寺少卿王瑞枬避山中，有欲荐令出者，自经死。振飞后赴桂王召，卒于途。都督胡献深与其妾衣冠对坐，饮药于私第。有赵昂者不肯薙发，从容刎死于家。先是阮大铖赴江干乞降，从清兵攻仙霞关，僵朴石上死。马士英既降，清兵至顺昌，搜龙扛得士英等请唐王出关己为内应疏，遂斩之延平城下（明纪、残明宰辅年表）。
福建既平，郑芝龙自安平奉表降。其子成功恸哭而谏，芝龙不听。成功与郑鸿逵、郑彩等各率所部入海（明纪）。
金坛人王祈聚众入建宁，属县多响应。清总督陈锦、张存仁、侍郎李率泰统兵六万来围建宁。永明王使揭重熙赴援，至邵武不能进，建宁遂破，王祈力战死（恽逊庵遗集）。
十月，桂王监国肇庆府。十一月即位，以明年为永历元年（小腆纪年以为十一月事）。命太保兵部尚书中极殿大学士陈子壮节制两广、江西、湖广、福建军务（残明宰辅年表、海上见闻录）。
——录自福建通纪卷十。
清世祖顺治四年（明永历元年、鲁监国二年、海上郑成功称隆武三年、一六四七）正月：先是鲁王南奔至石浦，张名振护王航海至舟山，守将王斌卿不纳。王浮海至厦门，复入南澳。郑彩率舟师迎王，王命彩讨杀斌卿，封彩建威侯。提督杨耿、彩弟总兵联皆以兵来会，进彩建国公、名振定西侯，耿同安伯、联定远伯、周瑞闽安伯、周鹤芝平彝伯、阮骏荡湖伯。鹤芝复海口，以参谋林钥舞、总兵赵牧为守。时尚书张肯堂募兵海上，贻书招之。前佥都御史金衢巡抚刘中藻以众来归，授为兵部尚书兼东阁大学士（南疆逸史、小腆纪年、残明宰辅年表）。
鲁以刘中藻督师浙闽。鲁王次闽安镇（残明宰辅年表）。
二月壬申，鲁王兵袭海澄。明日，攻漳州不克，总兵陈国祚战死。又明日，清兵攻海澄，南师退入于海（海东逸史、小腆纪年）。
世祖诏曰：『朕平定中原，惟浙东、福建尚阻声教，爰命征南大将军贝勒博洛振旅而前。既定浙东，遂取闽越；先声所至，穷寇潜逋。大军掩追，及于汀永，聿钊授首，列郡悉平。一切官民人等从前罪犯，咸赦除之。横征逋赋，概与豁免。山林隐逸，各以名闻录用。民年七十以上，给米绢有差』（清世祖实录）。
以佟国鼐巡抚福建（同上）。
以朱鼎新为左布政使、赵林翘为右布政使、杨御蕃为按察使（东华录）。
鲁王兵克漳浦，以闽人洪有桢为令；五日复陷（绎史作四月事）。彩至海坛征派，乡民不服，彩攻之，被诱深入，失兵将无数，退回，同鲁王至厦门。联纠合浦南桥义兵杨重等入漳浦县，以洪有桢为县令。未几县破，有桢被执，不屈，被剐。联复攻海澄，见敌骑至，即走争舟，多坠水死者。平和县曾庆等与诏安等处义兵立德化王慈华，陷大昌，攻顺昌、将乐，然皆为清兵所败（海东逸史、南疆泽史、海上见闻录、小腆纪年）。
案：漳州，逸史作漳平。洪有桢，见闻录作龚有桢，逸史作洪有文；龚洪音近而误。同安阮旻锡夕阳寮稿作有桢字亮士，嘉禾里人。今皆从其多者。
明监国鲁王遣兵攻福州，不克；又遣兵攻福清，不克（小腆纪年）。
郑彩及熊汝霖取福宁州，诸县响应，遂入兴化府。汀邵乱，进据建宁。清陈锦、佟国器、李率泰督兵至，破建宁，并复所失州县（海上见闻录）。
初，芝龙密谕成功，欲与俱见贝勒。成功谏，不从；鸿逵阴令逸去。芝豹奉母黄氏居安平。成功率所部入海；闻永历即位，遥奉年号，称招讨大将军。有众三百人，训练于厦门之鼓浪屿，委黄恺于安平措饷。识者知其可与有为，鸿逵旧将咸归心焉。成功以洪政、陈辉为左右先锋，杨才、张进为亲丁镇，郭泰、余宽为左右镇，林习山为楼船镇，攻海澄。数日，清兵至，洪政中流矢，与监军杨期演死之；遂退兵入粤。初，清兵下泸溪，以李光署县事。邑贡生魏一柱缚光送郑彩所剐之，画策守泸，败清兵于密潭。至是，王得仁（李自成部将，左梦庚率之投诚江右）族泸之丁、傅、魏三族。一柱弃妻子走闽，袭破将乐，结德化诸藩攻克建宁。清兵至，围而攻之，五阅月始破，一柱与诸藩俱死（海上见闻录、三藩纪事本末）。
三月，鲁周鹤芝攻闽安，林质复德化，再攻建阳，败死（小腆纪年）。
福州府学廪生林化熙全发被获，至府学兴贤坊口，望拜先圣，见总督张存仁，不屈，坐杀于宣政街（榕城纪闻）。
四月，明岑本高等攻浦城，为副将李绣败死（小腆纪年）。
郑成功复海澄。先是，博洛使人挟郑芝龙北行，随亲统马步兵入安平。芝豹仓卒弃城，率家属登舰泊外海，成功母田川氏独留守。兵入掠其地，氏拔剑剖腹死。成功闻报，痛哭出师，全军皆缟素。师至，博洛见帆樯云集，军容烜赫，大惧，星夜引兵还泉州；成功遂取海澄，入九都（清史纪事本末）。
郧西王复建宁，其裨将王祁复邵武。祁营山中，取民间几案数百张，每悬大线香数百炷，黑夜顺流，环城而过。守者谓祁兵薄城，炮石大下。迟明，方知其伪。城中习之，不疑。一日，祁突至，遂破（南疆绎史）。
五月，张存仁以周鹤芝据福州镇东卫并海口民城屡肆剽掠，副将满进忠等分兵击下，屠之（东华录、榕城纪闻）。
海口之下，林钥舞、赵牧死之，周鹤芝退守火烧屿（南疆绎史）。
六月，鲁王兵攻漳州，不克。钱肃乐来觐，授兵部尚书（海东逸史、南疆逸史）。
七月，鲁王亲征。会郑彩、周瑞、周鹤芝、阮进之师攻福州，败绩（海东逸史）。
义师起，八郡同日发，福州城中约举火相应。至期，烧鳌峰状元亭。时天色已亮，遂溃于金鸡山，杀举人林桓声，传牌保长三人。牌系义师令也（楁城纪闻）。
浙闽总督张存仁奏莒州洞贼李长蛟，伪军师王国用、陈泰钟等陷建宁府，总兵官李应宗、副将曹允吉死之。郑彩等亦于是日进口，烧断漳州江东桥，长泰、海澄、龙溪尽为彩等出没之所；余党分击同安、安溪诸处（东华录）。
八月丙戌，鲁王兵陷连江县治，据之；屯兵北岭，窥福州，索饷诸县（南疆绎史、海东逸史、连江志、小腆纪年）。
永宁王长子妃彭氏据九龙砦，纠兵数百人攻归化；败，妃奔洋源。初，江西破，妃寓汀州；清兵入关后，避匿永安、贡川间。有溃将范继宸知而迹之，输诚焉。继宸落魄山寺，久之至延祥，自露其事。乡之无赖遂密迎致妃；以继宸掌兵事、杨禾兄弟为前锋，聚众数万人，妃自督之（临汀汇考）。
郑鸿逵遣人语郑成功，安平地褊小，且无险可守；劝之取泉州，愿以师助。于是成功至自九都，会师于泉之桃花山。清提督赵国祚（一作佐）率数百骑冲营，成功将张进、杨才迎战。鸿逵遣林顺等夹攻，破之。别遣水兵破溜石炮城，斩清参将解应龙。时在籍御史沈佺期、光禄卿林桥升、主事郭符甲、推官诸葛斌皆举兵应。守西城将杨义、乡宦郭必昌之子显约内应斌，事泄，斌已率兵逼城，全军覆没。国祚杀郭显，灭其家。九月，漳州副将王进率兵来援，泉州围始解（海上见闻录、小腆纪年、清史纪事本末）。
十月（小腆纪年作九月），鲁王兵攻长乐、永福、闽清，皆下；罗源知县朱丕承、宁德知县钱楷皆以城降（海东逸史）。
鲁大学士刘中藻起兵攻福宁，镇将涂登华降。鲁王以前尚宝寺卿李向中为兵部侍郎巡抚福宁（海东逸史、南疆逸史）。
鲁兵部右侍郎林汝翥、吏部员外郎林敕起兵攻福清，据海口城；清兵克之，翥、垐被执，不屈死（南疆绎史、海东逸史、福清志）。
十二月，以陈锦总督浙闽（清世祖实录）。
郑彩攻福州，副将邹必科等败走之（同上）。
五年（明永历二年、鲁监国三年、海上郑成功称隆武四年、一六四八）春正月，鲁王在闽安镇（海东逸史、小腆纪年）。
明前大学士朱继祚起兵，会鲁同安伯杨耿袭兴化。分巡道彭遇颽，故南都御史也，伺其守将出战，乃登陴，尽易明帜；守将不敢入，城遂下（海东逸史、小腆纪年）。
原任浙闽总督张存仁奏明宜春王朱议衍自江西入据汀州山寨，总兵官于永绶破其寨，议衍就擒。命诛之（东华录）。
郑彩忌熊汝霖，夜遣兵杀之，并其全家及义兴侯郑遵谦（海东逸史、残明宰辅年表、海上见闻录）。
彭妃复率范继宸、廖心明等数千人由石城出禾□□、沙乌村，抵延祥驻焉（临汀汇考）。
二月，由延祥移营，复出归化雷涧，参将王梦煜邀击之，执彭妃。廖心明负妃子走石城，后不知所终。彭妃旋奉旨绞于汀州灵龟庙。妃死日，责数郡邑官，词义慷慨，毫无惧色（临汀汇考）。
鲁王以钱肃乐为东阁大学士，力辞弗许。时郑彩横专朝政，诸镇皆恶之。肃乐日中系艍王舟之次，票拟章奏；封进后，即解维别去。每入见，即流涕不止曰：『朝衣拭泪，昔人所讥，而臣今不能禁』！王亦潸然。江西金声桓遣部将郭天才援闽，与巡抚佟国鼐有隙，遂以兵归鲁王，封为忠勤伯（南疆绎史）。
官兵复连城、顺昌、将乐，擒鲁侍郎赵士冕、总兵黄锺灵等斩之（清世祖实录、东华录）。
三月，清兵克兴化，明大学士朱继祚、吏科给事中林嵋、兴泉道汤芬、知县都廷谏死之；克永福，里居给事中邬（胜朝殉节诸臣录作鄢）正畿、御史林逢经死之；克长乐，里居御史王恩及（小腆纪作作王恩）死之；克建宁，明郧西王朱常潮、守将王祁死之，祁巷战不胜自焚。鲁王在闽，先后复三府、一州、二十七县，温、台响应，军声颇振；至是皆失，仅留宁德、福安二县（海东逸史、小腆纪年、南疆逸史）。
四月，宁化贼邹华率邱选合大禾尚等攻本县，副将高守贵却之。大禾尚，江西明宗室，不知其名；先窜龙上里大坑口，一时响应，聚众数千。闰三月，遣牌至宁化谕降；至是与邹合（临汀汇考）。
五月，流寇乘江西金声桓之变，聚众十数万逼汀州，总兵于永绶、副将高守贵力御之；大小数百战，城中米一石价十六两、豆麦一石价十两，饥莩载路。七月，寇退，米价稍平（临汀汇考）。
郑成功攻同安，守将王彪、祁光秋出战。成功遣将甘辉败之，彪、光秋弃城走；遂取之（三藩纪事本末、清史纪事本末）。
六月，提督刘忠率兵入连江县平贼（连江志）。
明桂王命少师兼太子太师吏兵二部尚书建极殿大学士姜曰广督师江西，恢复京湖闽浙（残明宰辅年表）。
鲁王兵部尚书大学士钱肃荣卒。王震悼，辍朝；赐祭，予谥荫（南疆绎史）。
七月，清帅佟国鼎、李率泰、陈锦合师逼同安，成功部将邱缙、林壮猷守大盈岭以扼泉师，金作裕守苎溪岭以扼漳师，知县叶翼云督民兵守城。清领旗黄有信率骁骑冲突，缙中流矢，壮猷不支遁入城，作裕闻之亦敛军回，分门死守。清师晓夜攻击。八月，城破，缙、壮猷、作裕皆巷战死。翼云曰：『今日犹得死于明土，吾辈之幸也』！与教谕陈鼎皆不屈死。清师以城内坚拒不下，屠之，死五万余人。初，同安有陈世冑者，绰号泥鳅；闻仙游罗汉山王志章能剌阴阳事，世称生阎罗，往候之。志章预置片纸，使童子授世冑读之，有「泥鳅死半途，同安血流沟，嘉禾断人种，安平成平浦」之语，悚然奔告成功；成功妄之。既而，世冑果至小盈岭暴亡。同安之屠，血流沟渠。是后，凡获满兵，辄断其踵放回，欲以厌「嘉禾断人种」之谶。嘉禾，厦门旧号也。康熙癸卯，李率泰请弃诸岛，安海城竟毁拆，厦门迁空无人者一纪，果断人种。安平在界外，亦遂成平浦焉（海上见闻录、小腆纪年）。
朱成功在铜山修船练兵，闻同安告急，整师往救。抵金门，而同安已破。清漳浦守将王起俸谋降事泄，弃家从旧镇奔铜山。成功以为总练，使同柯宸枢联络铜山等处募兵措饷，诏安县人林日灼鼓众拒之；成功令甘辉击斩日灼，复诏安（小腆纪年、清史纪事本末）。
浙闽总督陈锦奏郑彩等连■〈舟宗〉千余，盘踞长乐、连江等县；陈泰、李率泰分兵夹击，尽驱出海，长、连二县次第恢复。又统师直入兴化，生擒伪总督顾世臣等十二人斩之。兴化平（东华录、清世祖实录）。
有粤寇张、黄二姓，不知其名，由永定、上杭出清流属乡而抵延祥。杨禾兄弟恃勇与战，败死；寇遂出归化。时又有游僧伪称隆武者，愚民信之，亦聚众数百人。张、黄应之，同犯归化。归化坚壁以老之，乃去。至永安，游僧被诱，歼焉。张、黄独疑，不入城，宵遁。是时，四乡皆贼营矣（临汀汇考）。
清以张学圣巡抚福建（清世祖实录）。
十月，明封郑成功为威远侯。成功寻复云霄，降将张国柱败殁，守备姚国泰就擒（小腆纪年、清史纪事本末）。
鲁大学士马思理卒。沈宸荃相，刘沂春副之（南疆绎史）。
十二月，郑鸿逵、郑成功复福建沿海州县，奉表报闻于桂王（永历实录）。
是岁大饥，成功及彩各发兵民船至高州籴米；州为桂王总兵陈邦傅所辖，成功船免饷。时斗米千钱，海上藩镇分驻各岛，鲁王别将周鹤芝、周瑞、张名振、阮美守舟山，彩、联守厦门；鸿逵守安平之白沙，使其将陈豹守南澳；成功泊厦门，以芝鹏护家眷、张进守铜山、郑香守海澄之石尾（后为清兵所破，二子广海死焉）。粮饷缺乏，取之民间，而彩营将章云飞扰民尤甚。鸿逵遂率舟师至潮州，随地取饷。时闽中旧相张肯堂以私财募兵海上，鲁王贻书约共事（海上见闻录、三藩纪事本末）。
是年，清命霍达巡按福建（贰臣传）。
六年（海上称永历三年、一六四九）正月，监国鲁王次沙埕（南疆逸史、永历实录、三藩纪事本末）。
广东李成栋迎永历。诏各勋镇考试诸生赴广省，郑成功送生员叶后诏、洪初辟等十数人，同黄志高赍本赴行在。舟至潮阳，遭风不得达；独志高至粤，诏以为兵部职方司主事，使监成功军。封成功为广平王，命以舟师取南都；其后成功入长江，承此诏旨也。漳浦副将王起凤（一作俸）密赴成功纳款，谋泄，弃家由龟镇至铜山投见，授以都督同知，挂统练军门印（三藩纪事本末、海上见闻录）。
明郑鸿逵复泉州；入奏桂王，优诏奖励之（永历实录）。
浙闽总督陈锦奏福州总兵张应梦复罗源县，右路总兵马得功复永春、德化二县，擒其总师颜昌儒等，平三百余寨（东华录）。
开福建鼓铸（同上）。
二月，郭天材溃兵以铁骑千余突来攻宁化城，至夜遁去（临汀汇考）。
三月，清兵复取明宁德（小腆纪年）。
郑成功遣施琅、杨才、黄廷、柯（一作何）宸枢等攻漳浦，守将王起凤降；留黄廷、洪政守漳埔之罗山岭，柯宸枢守盘陀岭，自统兵下诏安，屯分水关（小腆纪年、三藩纪事本末）。
浙闽总督陈锦奏福清等二十县士民同心效死守城，忠义可嘉；请免本年丁徭，以示鼓励。奏下部议（东华录）。
夏四月，清兵克福安。明兵部尚书大学士刘中藻衣冠坐堂上，为文自祭，服金屑死。其部将董世南（小腆纪年作世上）亦死之。翰林院简讨兵科给事中钱肃范被执，不屈（南疆逸史、海东逸史）。
福建巡按霍达奏官兵复平和、诏安、漳平、宁洋四县（清世祖实录）。
调王之纲充汀州总兵官、马得功充泉州总兵官（同上）。
五月，以丁文盛为福建左布政使、周亮工为福建右布政使（东华录）。
六月，清兵攻陷福建沿海州县（永历实录）。
鲁定西侯张名振复健跳所，遣使迎鲁王（南疆绎史）。
七月，鲁王复入浙，次健跳所。郑彩弃王去，从王者大学士沈宸荃、刘沂春、礼部尚书吴锺峦、兵部尚书李向中、户部侍郎孙延龄、左副都御史黄宗羲、兵部职方司郎中朱养时、户部主事林瑛及右佥都御史张煌言等，每日朝于水殿（南疆绎史）。
十月，明兵陷兴化府，署府事福州府推官黎树声死之。抚按以闻，赠树声本省按察使司佥事，荫一子入监读书（东华录）。
海上兵进云霄港，由白塔登岸。守将张国柱迎战败死，中军姚国泰拒守。城破，国泰重伤，获之，令医治送军前收用。遂进攻诏安，驻营龙峰、磁灶等处。清副将王之纲等调集各县兵，攻盘陀岭；值大雾，诸军各不相顾，宸枢同其弟宸梅俱战死，成功大痛（海上见闻录）。
案宸枢之死，三藩纪事本末以为本年三月事、小腆纪年以为明年六月事，且有失浦、诏语；然浦城并未失、诏安并未得，何失之可言？今不从。
十一月，清兵克延平将军寨，明德化王慈烨死之（小腆纪年）。
郑成功解诏安围去（海上见闻录）。
十二月，粤中遣使封郑成功为延平王（海东逸史）。
七年（海上称永历四年、一六五○）三月，浙江福建总督陈锦奏官兵生擒明新建王朱由模及其党朱由柍、黄继盛，命斩之（东华录）。
四月，郑成功攻揭阳之新埠寨，克之；寻诏安人张礼率众数千归之（清史纪事本末）。
六月，郑成功围潮州，降将王邦俊闻之率兵取云霄（清史纪事本末）。
是月，郑成功引兵攻苏利，不克。郑芝鹏、芝莞说成功取厦门；用施琅策，以米千石饷郑联，欲袭取之。联不疑，彩曰：『是毒药也』！议全军出避，联不从（海上见闻录）。
七月，桂王命曾樱以原官督师闽浙（永历实录）。
八月，郑成功取厦门、金门。厦、金两岛为郑彩、郑联所据，时彩远出，惟联在厦而嗜酒。十五夜，联宴于万石岩，成功船至，尽收其战舰兵卒；陈俸、蓝衍等皆归附，拨亲随兵守眷宅。诘朝，联出迎，将士詟服不敢动。芝鹏因说成功邀联饮万石岩，夜归，伏甲于路杀之，遂并两岛。彩以舟师百余艘逃于广南海之间，招之不至。以周瑞为水师右军挂印，黄大振为援剿前镇，蓝登为援剿后镇，芝莞守厦门，阮引、何德管水师，蓝登管陆师，军威大振（海上见闻录、清史纪事本末）。
清定福建官兵经制（东华录）。
九月（小腆纪年作八月），郑彩与郑成功争厦门，为成功所败，泊沙埕；张名振击破其余兵（海东逸史）。
十月，郑成功取铜山、南澳、闽安诸岛。成功命洪政招安，诸岛悉听约束（小腆纪年、清史纪事本末）。
福建提督杨名高奏官兵进剿邵武，擒明宁南伯洪国玉、总兵李安民、阁部揭重熙，命斩之。甲申之变，原任福宁州知州揭重熙同副总兵洪日升起兵勤王。南京破，重熙复招集乡勇徐组绶等起兵湖东，会益王兵起；既败，重熙复趋福州。闻唐王赴赣州，倍道趋之，为清兵掩击，大溃。收散卒至安东诸砦，令联络以待；而身入南昌，以觇虚实。五年，金声桓与王得仁以南昌叛，迎重熙；重熙赴粤求援。金、王败死，其故将张自盛归重熙驻闽，重熙赴其军。是年，自盛掠邵武，战败被执。重熙至百丈■〈石祭〉，亦被执；至建宁，日求死。十一月三日，戮于南街市口（东华录、三藩纪事本末）。
十二月，郑成功率舟师援粤东。成功闻广州事急，以芝鹏守厦门，自率诸镇南下勤王（清史纪事本末）。
八年（海上称永历五年、一六五一）闰二月，郑成功师次平海卫。闽抚张学圣乘其远出，同提督马得功集同安县十八堡、刘五店各处民兵及船攻厦门。芝莞怯懦，载辎重下船。得功数十骑先从五通登岸，无御之者。守高崎水师镇阮引不战而退，城中百姓号声动地。成功妻董氏抱木主至海边不得船，居民林礼于水中负登舟，至芝鹏船。是夜，乱兵毁店舍，火光竟天。前大学子曾樱在城中，家人掖之出，樱曰：『比一片清净地，正我死所，将何之哉』？缢于所居楼上。学圣渡海，见岛屿孤悬，波涛汹涌，惊为绝地，即引兵回，令知县张效龄安抚居民。马得功走篔筜港，鸿逵命扬抒素截港围之，部将吴勃战死；施朗率陈埙、郑文星登厦门港与战，得功几为所及。得功求过海，鸿逵以舟载得功三百骑及余兵内渡（海上见闻录、永历实录、清史纪事本末）。
四月一日，郑成功自天星所回师到浯屿，不许诸将与鸿逵相见，鸿逵移屯金门之白沙。十日成功驻厦门港，议失守功罪，赏施朗银二百两、陈埙一百两、斩芝莞、阮引以徇，何德捆责、蓝登免罪，命洪旭管理中军。张名振、周鹤芝、阮骏等自舟山来归，授水师镇。潘庚锺等为参军（海上见闻录）。
郑成功亲阅各要口，筑炮台，拨劲旅守之（清史纪事本末）。
五月，郑成功与清总兵王邦俊大战于漳浦之南溪。成功愤厦门金穴之覆，率中提督甘辉、左先锋镇苏茂、中冲镇蓝登、宣毅左镇杜辉、援剿后镇陈魁、左冲镇郭义、右冲镇蔡禄、后冲镇林明、前冲镇统领余新、奇兵镇杨祖、智武镇蓝衍等从南溪登岸，漳州总兵王邦俊列阵于磁灶以待。杜辉、蓝登奋勇争先，矢将尽少却；余新、杨禄、陈魁左右夹击之，邦俊遂溃，闭城不出（三藩纪事本末、小腆纪年）。
九月，郑成功攻漳浦（小腆纪年）。
鲁王监国入闽，工部尚书兼东阁大学士沈宸荃扈从（永历实录）。
十一月，清提督杨名高与郑成功兵战于小盈岭，伏左右起，兵溃没几尽，遂遁返泉州（清史纪事本末）。
十二月，成功乘胜进薄漳浦。守将杨世德、陈尧策出降，授世德英兵镇、尧策护卫前镇。英义将军阮骏自舟山来归，清海澄守将郝文兴亦遣人通款。成功以人多饷乏为忧。参军冯澄世曰：『方今富足，莫如日本，前翁太夫人来归，国王意甚厚，若以甥礼通之，借彼地产，以足吾用，然后下贩吕宋、暹罗、交址诸国，源源不绝，则粮饷足而进取易矣』。成功然之。既获日本铅铜之助，又以黄恺为征饷官，督征漳、泉、福、兴沿海军饷（小腆纪年）。
九年（明永历六年、鲁监国七年、一六五二）正月朔，鲁定西侯张名振、大学士沈宸荃、兵部右（一作左）侍郎张煌言扈鲁王至厦门（海东逸史）。
郑成功以宗人府府正礼朝见鲁王，行四拜礼，贽千金、紬缎百疋，供应甚殷；从臣亦皆有赠。寻奉王居金门（海东逸史、小腆纪年）。
郑成功取海澄。成功乘潮大涨，航海直抵中权关。守将郝文兴已有密约，迎成功入城，授前锋镇挂印。以参军黄维璟知县事。有同安浯州人周全斌投谒，成功问『策将安出』？全斌对曰：『以大势论之，藩主志在勤王，必先通广西、达行在，会孙可望、李定国连师粤东，出江西，从洞庭直取江南，是为上策。今李成栋已没、广州新破，是粤西之路未得通，徒自劳也。今且固守各岛，上踞舟山以分北来之势、下守南澳以遏南边之侵，兴贩洋道以足粮饷，然后取漳、泉以为基业，由汀郡、福兴水陆并进，则八闽可得矣』。成功大悦，授房宿镇（海上见闻录、小腆纪年）。
二月，郑成功进兵攻长泰，部将吴世珍奋勇登城，死于炮。成功令火器营何明凿地道，用地雷轰其城（海上见闻录）。
三月十日，地雷发，不及城而止。总督陈锦督马步数万来援；十一日，营于牛蹄山，相去五里。成功乃移营江东桥。锦欲击之，游击张玉谏曰：『海贼国姓，少年英勇多诡计，见扎江东，未可遽进。且深沟固垒，密通漳镇。遣一旅由长泰小路击之，使彼首尾不顾，乃可破也』。锦斥曰：『此蝥贼何足挂齿』！麾军逼战。十三日，亲来冲营。成功率诸将迎击，锦大败，全军俱覆，奔回同安。王进弃长泰，以数十骑走漳州。初，漳州副将王进勇无敌，号老虎。成功部将甘辉与战于北溪，两马相搏不相下；已而两家兵至乃解，进入长泰。城破，进走郡城。陈锦之败也，惭愤；偶食不如意，鞭奴库成栋几死。栋刺杀之，以其首奔成功（赐姓始末：陈锦为内竖李进忠五人所刺，当是库成栋之党）。成功叹曰：『仆隶之人而皆戕其主，是天下无刑也』！厚给其家而枭成栋首示众，岛民大服（小腆纪年、皇朝年表）。
长泰守将杨青弃城遁，成功以参军冯世澄知县事、甘辉为中提督、黄廷为前提督、黄山为后提督。于是平和、诏安、南靖皆下（海上见闻录、小腆纪年）。
四月，进围漳州，清浙江金衢镇马进宝（号金衢马，一作逢知）率兵来援。成功召诸将问计，甘辉请战。成功曰：『不然。凡用兵之道，岂可全恃勇力？当明彼此之情。今陈锦新丧，提调无人，以素骁勇之进宝来，必以一当百。今且勿战，纵之入城，然后围之。城内人多、粮必乏，外调既迟，内势窘促，破之必矣』。乃撤万松关及龙江兵，令避援兵。进宝率精骑一千、步兵三千驰至灌口，不见敌，将安营，而四面摇旗吶喊，终夜不散；卸甲登高，见营栅布满山谷，惟往漳一路无阻，引军入城。成功进兵围之。进宝与王邦俊从东门出战，成功令陈胜、陈斌、苏茂、萧泗迎战，而自与甘辉、周全斌、陈尧策、郝文兴云梯攻城。进宝奔回，婴城固守。诸军攻围不下，议筑镇门象鼻山截溪流不得入海，欲以灌城，而奔流迅急，堤不得合。成功不攻城，筑长围以困之。城中兵括富户及百姓粟食之，民相枕籍饿死；杀人为食，至有妇人群聚击男子而分食其肉者，毋论鼠雀及树根、木叶、水萍、纸及皮之属尽食之。稀粥一碗值四金。自四月至十月，城中死者十之七八，城中百姓裁余一、二百人。第舍万间，率洞开不闭，室中虚无人。其一、二百人者，指沟中白骨，历数其生前姓氏、里居语人。有士子率妻子阖户一恸而绝，邻舍儿窃煮食之，视肠中累累然皆纸絮不化，邻舍儿亦废箸自绝。后署守道周亮工收髑髅凡七十三万有奇，焚埋于东门外，名曰「同归所」；筑万善庵其上，勒石记之。城外死者，骸骨无数，不与焉（海上见闻录、三藩记事本末、小腆纪年、说铃、簪云楼杂记）。
九月，成功督师入漳浦。清总兵固山金砺领浙直八旗兵及汉兵万余人入闽来援，至泉州，成功解漳州围，退屯古县，据险以待。金砺由长泰入漳州。十月二日晨，西北风盛，金砺率满骑冲营。成功营火箭、火炮皆反风自焚，满兵乘烟冲突，成功兵溃，退屯海澄，黄山、陈俸、廖敬、郭廷、洪承宠皆战殁（海上见闻录）。
是月，张天禄奉命赴闽援漳州。抵延平，擒黄云纪、陈天铎等。会都统金砺已解漳州围，天禄留驻延平，剿各山贼（贰臣传）。
清世祖赐浙闽总督刘清泰敕，令招降郑成功（东华录）。
十一月，施朗前在南湾，苏茂代之；欲复任，成功不与。会朗有亲兵曾德逃成功所，朗促杀之。成功怒，令执朗与林习山拘在船中，以副将守之。朗家人假成功令调回审究，吴芳即同登岸。至草湾，朗击吴芳及从人仆，逸去；藏山穴中两日矣，夜投苏茂。茂以小舟载渡海投诚，改名琅。成功欲斩习山未果，杀吴芳妻子及朗父大宣、弟施显，以中协林胜为援剿左镇（海上见闻录、小腆纪年）。
十年（海上称永历七年、一六五三）正月，鲁王在金门（海东逸史）。
二月，浙闽总督刘清泰奏厦门一窟系郑氏老巢，抚臣张学圣、道臣黄澍、镇臣马得功垂涎金币，乘成功他出，潜师往袭，悉攫其家赀，以致郑氏索偿修怨；海郡沦陷，按臣王应元徇隐不奏；深负巡方、言官之职，请交部议罪。得旨：张学圣、马得功、黄澍、王应元俱革职，着刑部速差满官拏解来京，严讯具拟（东华录）。
三月，鲁王自去监国号，奉表行在（南疆绎史、永历实录）。
郑氏攻镇东、海口、松下、大祉、小祉，焚劫乡社。攻海坛时，土寇陈西宾迎拒，败降；以周崔之守之（台湾日录）。
四月，清固山额真金砺调水陆官兵船只欲攻海澄。成功遣水师林察、周瑞、周鹤芝、阮骏、黄大振等堵截诸港，郝文兴、王秀奇、陈尧策偕万礼守镇远寨，黄廷、甘辉守关帝庙木栅，成功驻天妃宫亲行督战。海澄城坏十余丈，成功坐将台指挥自若。忽一夕，砺营空炮递发，成功惊曰：『敌将临城矣』！令勒兵以待（清史纪事本末）。
五月四日，金砺至天妃宫前，安大小炮数百号，连击木栅，兵多击死。五日，后劲镇陈魁、后冲镇叶章率精勇数百，乘炮烟冲进；叶章死之，陈魁伤左足。成功令收兵固守。以周全斌管后冲镇、扬正管后劲镇，率诸将上敌台望，张盖而坐。清炮火齐发，甘辉急翼成功下，而位随击碎矣。镇远寨新筑筑篨崩坏如平地，令军士掘地藏身。火器营何明率洪善就夜分埋火药河沟边，药心相续，候令而发。六日黄昏，满兵炮火不绝。至五鼓，头迭绿旗兵、二迭满兵，填壕攀栅而上，兵皆重铠，刀不能伤。城上兵俱持大斧击之，坠则后列者乘其尸而登。三迭满将齐进，锐不可当。天色渐亮，满兵大半过河，而所埋地炮发烟蔽天，过河者尽死；其未过河者，甘辉截击之。金砺精锐尽丧，逃回。十二日，成功回厦，于教场设宴犒诸将士。以忠孝伯印付甘辉，辉不敢受。以擅离海澄县，杀知县黄维璟。遣监督池士绅赍蜡丸表由陆路诣永历行在，永历遣兵部主事万年英赍敕晋封成功延平郡王。成功以海澄功，请封各镇；封甘辉崇明伯、黄廷永安伯、万礼建安伯、郝文兴祥符伯、王秀奇庆都伯、参军冯澄世太仆卿兼都察院御史（海上见闻录）。
六月，郑氏围东岱。游击宋天禄御之，斩首数百级，乃遁入海，溺死无算，积尸乘潮至通济桥，江水数月不堪食（连江县志）。
十月，同安侯郑芝龙奏：前命招抚逆弟鸿逵、逆子成功，臣即遣人贻书宣传圣意，俱未受封。初，广西李定国差人致书成功，约以舟师直取江南，而郑芝龙在京，遣家人李德，称有诏封成功海澄公。九月，京中遣内院学士叶成格、理事官阿山与成功弟渡舍、荫舍赍四府安插兵众敕至。十九日，李德、周继武先到厦门，传知先剃发、后受诏。至十月，渡舍回泉州，约二使到安平，先受诏而后剃发。十七日，二使至，设供帐于报恩寺。二使就布栅安诏敕，成功不受。报父书末曰：『万一不幸，儿惟有缟素复仇，以结忠孝之局耳』。复遗书与渡舍曰：『兄老矣，岂有舍凤凰而就虎豹者哉？惟吾弟善事父母，勿以兄为念』。二十日，二使回泉州，促渡舍、荫舍并芝龙后娶颜氏及芝豹回京复命。抚事不成，置芝龙于高墙、戍芝豹于宁古塔。成功遣林察等率五镇战船南下，赍表永历行在，并复书与李定国（海上见闻录、清史纪事本末）。
案三藩纪事本末作明年十月事。
十一月，漳州千总刘国轩以总镇张世耀新任、兵未协，遣人来约期献城降。于是遣洪旭、甘辉、林胜、戴捷等于十二月一日夜至漳州南门，云梯而上，国轩引之；世耀仓卒不知所为，与知府房星华、知县周琼、理刑王元衡降。洪旭入城安辑。四日，成功抵漳州，以国轩为护卫后镇；诸属县皆降。遣诸将徇泉州属县，亦降；惟府城为副将韩尚亮坚守（海上见闻录）。
案三藩纪事本末、小腆纪年作明年十二月事。
十一年（明永历八年、一六五四）正月，鲁王在金门（海东逸史。小腆纪年作移居南澳）。
七月，以佟代总督浙闽（清世祖实录）。
八月，增福建浦城县枫岭营，以游击、守备各一员、兵一千名驻扎。撤常山广济驿，移长汀三洲驿为小关驿，移上杭蓝屋驿于浦城为柘浦驿（东华录）。
十二月，福建巡抚佟国器奏：郑成功势及兴化，请迅发满洲大军进剿，并敕调潮州水师直抵厦门，与闽师首尾夹击（东华录）。
以杨捷、马得功充福建随征总兵官，马逢知（一作进宝）加左都督，随征福建左路（清世祖实录、逆臣传）。
十二年（海上称永历九年、一六五五）正月，鲁王在金门（海东逸史）。
郑成功攻仙游县，破之（海上见闻录）。
二月，郑氏设六官，以潘庚锺为吏官、洪旭为户官、郑擎柱为礼官、张光启为兵官、程璠为刑官、冯澄世为工官；设协理各一员、左右都事各二员。以常爵宁为察言司，掌六卿印；邓会、张一彬为正副审理。设储贤馆，以前所试诸生洪初辟、杨经、阮旻锡、陈昌言、陈鹏羽、杨芳、叶儒羽、吕鼎、陈继明、林复明及荐举人士薛联桂、邓愈等充之；设储冑馆，以死事诸将及侯伯子弟柯平、林维策等充之。改中左所（即厦门）为思明州，以薛联桂知州事（海上见闻录）。
三月，调佟国器巡抚南赣、宜永贵巡抚福建（清世祖实录）。
福建巡抚佟国器获同安侯郑芝龙与其弟鸿逵、子成功交通私书，羁其使，具奏封进。下兵部密议（东华录）。
四月，郑成功以郝文兴为提督、万礼为后提督、王秀奇改为右提督、林胜代为戎旗镇、黄昌为援剿左镇、黄梧为前冲镇。林察等应援李定国不及，成功怒，降责有差。委户官洪旭任水师右军；潘庚锺兼管户官，吴慎为协理佐之（海上见闻录）。
六月，闽督刘清泰遗书郑成功，有曰：『固山枕戈久矣，有不能顷刻待』。成功览书笑曰：『彼以劲旅挟吾，吾岂惧一固山哉』！不报。朝命郑亲王世子济度（一作渡）为定远大将军，率旗兵、汉兵约三万赴闽。成功从冯澄世策，堕安平镇、漳州府惠安、南安、同安三县城，回师厦门（海上见闻录、小腆纪年。见闻录作四月事，不从；回厦门作回漳州）。
七月，以甘辉为正总督、王秀奇为副总督，率二十余镇北上，与洪旭、陈六御相机而行；以黄廷为正总督、万礼为副总督，率二十镇南下（海上见闻录）。
八月，清世子济度至福州，调集绿旗马步并进。成功令思明州居民及官兵眷口移金门、镇海等处，空岛以待。调戎旗镇林胜守思明，并调回洪旭北上师，以陈六御、张名振、阮骏等镇守舟山。授巴臣功骁骑镇，改名臣兴。洪旭入台州港；守台州马信降，授中权镇（海上见闻录）。
九月，贝子王同固山额真都察院承政土赖统率满洲兵披甲及汉军乌金超哈三万驻闽（福州府志）。
十月，满洲兵至，驻南门、水部、东门各郊外，住人家，索酒肉金帛，役使主人饲马，稍违即捶楚交加。中有明甲、暗甲马凡万余匹，取锅万余口、草刀万余把、■〈金〈白上廾下〉刂〉马槽万余个，皆民间办给。一马每月支榖六百斤、草若干。每旗用锉草夫百余名，每名工日值一钱二分，或用人、或折银。上榖则有收榖官吏、上草则有收草官吏，贿托不称意，则赔费甚多。驻二十日，往漳州（榕城纪闻）。
十三年（海上称永历十年、一六五六）正月，鲁王在金门（海东逸史）。
二月，调李率泰总督浙闽（清世祖实录）。
以马得功充提督福建总兵官、张承恩充福建左路总兵官（请世祖实录）。
停福建鼓铸（东华录）。
三月，提督马得功复用，纵兵掠杀（榕城纪闻）。
四月，世子济度攻明厦门，复攻金门，皆败还。先锋韩尚亮掠厦门，会飓风大作，复大雨淋漓，船不得泊；满兵皆颠眩断椗，坏■〈舟宗〉之声，震荡魂魄。其被风飘至两岛者，皆断其手掌纵之归。时济度侦知郑成功积聚在金门白沙寨，令王进功攻之。甫出港，遇洪旭哨船，乘波酣战，复大败；遂退入泉港（清史纪事本末）。
五月，以刘汉祚巡抚福建（清世祖实录）。
六月，郑成功至思明州，议揭阳丧师罪（在本年正月，以非本省事未载），斩左先锋苏茂，杜辉捆责；黄梧记责，照旧管事，罚铠甲五百赎罪。以周全斌为左先锋；郭遂第改名华栋，为后冲镇。黄梧代王秀奇守海澄县，梧同苏茂弟明据海澄降清，陈剿海五策：一、屯沿海以堵登岸；二、造小舟以图中左；三、清叛产以裕招徕；四、锄奸商以绝接济；五、铲伪坟以泄众愤。封梧为海澄公，镇漳州。梧荐施琅为副将。同安城守苏明召至京为内大臣。后梧请株求郑氏亲党，徙沿海居民，漳、泉之间大遭其祸。清世子调各湾船，令泉州城守韩尚亮出泉州港；成功令诸镇出围头迎击。援剿左协王明击沉一船，信武营陈泽等乘势追赶，忽飓风大作，诸镇舟收泊围头。泉州船有收入围头被获者，有飘入贵屿、金门登岸乞降者，有飘至外洋至黄海者，收回泉港不满十只。由是不敢渡海（海上见闻录、清史纪事本末）。
七月，成功遣甘辉等入闽安镇；至省城南台桥，登岸扎营。成功谍知省城无兵，令取福州。而差船失其谕帖不至，遂掠南台、潭尾等处（海上见闻录）。
成功进攻福州，三战三捷，斩副将胡希玠，擒参将张礼，于是守将望风降。成功不为备，会城外伏兵起，仓猝乘潮解椗退闽安（小腆纪年、清史纪事本末）。
八月初四日，郑成功兵陷连江县，知县杨继生死之。十六日，陷东岱堡，屠其乡。十九日，提督马得功复县城，遂救东岱，成功毁城遁。东岱为连江咽喉，将入县，必先攻堡；其民俗强悍，勇于战斗。成功屡攻不下，遂先攻县；及县陷，复反攻之旬有余日，矢石并发，终不能近。因掘地内炮裂其城，众溃入之，杀戮无遗；兵退，邑诸生王治观弃产为冢瘗焉。是时，成功复移攻北茭焚掠，分遣一舟至马鼻索饷，以三日为限；陈某造其舟请缓期，怒执之。其女某鸣金号众，定议；当早潮水退，舟胶泥难动、兵眠未寤，合乡各乘泥板执狼牙竹围之，争抛以泥，舟滑不可立，奋击毙之，举舟无得脱者。（泥板即古之橇，海滨人于泥中乘之如飞）（连江志）。
九月，成功至闽安镇相度地势，令冯澄世、林胜、万礼筑寨镇守之。罗星塔亦筑士堡，以陈斌、林铭、杜辉等守之。马江萧家渡设水师，以裴德守之。成功出屯壶江、定海、凰埔等处，复改连江（海上见闻录、连江志）。
十月，成功驻三都。清世子攻铜山，后冲镇郭华栋击败之。以王秀奇总督五军、马信管左提督（海上见闻录）。
十二月，成功令甘辉、周全斌取罗源、宁德等县。舟师自梅溪登岸，由飞鸾渡、白鹤岭至罗源，围城数匝。城内兵共三百人，知县陈钦如同营将李应先戳力守御，驰蜡书赴省请援。清世子遣梅章京阿格商巴都、柯如良带兵数千赴援。时芝龙差谢表劝成功就抚，李率泰亦差人说退兵以就抚局。成功令诸镇兵皆退，甘辉断后。至护国岭，满州先锋骑数百追至，见阵整不敢逼。辉令抽兵度岭，亲督数千在后。阿格商至，挥兵欲蹙之，别将劝止。阿格商曰：『此易取耳，当尽歼之』！至岭下，身自下马，诸将骑皆步行上岭。箭如雨发，路狭兵不得成列。甘辉挥刃大呼，从高趋下，兵殊死斗。满兵崩坏，阿格商中数刃，犹大战；马信断其首，埋于田中，余杀死甚多。甘辉即下令收兵，而别镇追者为满骑所杀退。朝命抚臣佟代致书成功议款，成功不报（海上见闻录、三藩纪事、福州府志、清史纪事本末）。
十四年（海上称永历十一年、一六五七），鲁王在南澳，郑成功驻三都（海东逸史）。
三月，郑成功令万礼等守闽安镇、罗星塔等处，而自率诸镇北上至镇下湾，阻风，遂回思明州（海上见闻录）。
定国公鸿逵卒于金门所（海上见闻录）。
五月，移郎名赛固山兵驻防福省，屯城中东门、汤门、水部三关，民居概令搬移住兵，谓之「匡屋」，为满州营。其兵正披甲三千、家眷亲戚人四五万，亦分八旗，号汉军，满语曰「乌金超哈」，八梅勒统之曰将军（榕城纪闻）。
六月，台湾红夷长揆一遣通事何斌送外国宝物与郑成功，求通商，愿年输饷五千两、箭桴十万枝、硫黄一千担；许之（海上见闻录）。
浙闽总督李率泰密奏：郑成功父子诡秘，芝龙不宜流徙宁古塔；恐由此而遁，则将来沿海为患，不可胜言。下兵部速议（东华录）。
七月，成功委洪旭督水路四镇守思明州，亲督戎旗等镇进攻兴化黄石；分遣甘辉进札涵头，取粮三日，遂抽进狼崎。令前提督黄廷镇守闽安镇、护卫陈斌守罗星塔（海上见闻录、小腆纪年）。
九月，桂王遣彰平伯周金汤、太监刘柱从海上至，赍延平王印敕，晋封潮王招讨大将军，赐尚方剑，便宜行事（小腆纪年以为明年正月事）。成功欲恢复南京然后称王，文书舍示只称令旨而已（海上见闻录、清史纪事本末）。
十一月，成功攻海澄之鸥汀堡。邻村入堡避贼者七万余；堡破，同日受屠。有僧瘗之于陇子之原，题其碣曰「同归域」（道古堂诗集）。
案海上见闻录以为明年十一月事。
十五年春（永历十二年、一六五八）正月，鲁王在南澳（海东逸史）。
明册封郑成功部将王秀奇为祥符伯、马信为建威伯、甘辉为崇明伯、黄廷为永安伯、万礼为建安伯、陈辉为忠靖伯、洪旭为忠振伯、郝文兴为庆都伯，余拜爵有差（小腆纪年）。
成功驻思明州，筑演武亭练兵。以石狮重五百斤为的，力能挺起者拨入左右武卫亲军，皆配云南斩马刀、弓箭，带铁面，穿铁臂、铁裙、用锁锁定，使不得脱。时谓之「铁人」（海上见闻录）。
以吴万福充福宁总兵官（清世祖实录）。
五月，福建巡抚刘汉祚奏：提督马得功、梅勒章京傅大受等破郑成功兵于白沙，斩馘无算。下所司察叙（东华录）。
成功以前提督黄廷守思明州，与洪旭同商机务，郑泰拨给兵饷；余诸提镇俱北上（海上见闻录）。
七月，谕吏部：浙闽旧设总督一员，今海氛未靖，幅员辽阔，势难兼顾，除见任总督外，着再设一员，分理两省军务。尔部即会推堪任者引见；其各驻扎地方，一并议奏（东华录）。
十月，郑成功在台州港。闽总督李率泰调集漳泉水哨，世子拨披甲下船围罗星塔。又调集民夫自鼓山开路达闽安镇，满兵水陆并进。前提督右镇程余守顶寨，战死，遂失闽安镇。护卫前镇陈斌、神器镇卢谦守罗星塔，被困无援。施琅在总督军前，使人招降陈斌兵，斌遂降。琅复说李率泰杀之南台桥，凡五百余人。成功弃台州南下，已无及矣。遂以陈尧策督数镇守狼崎，而自回思明州（海上见闻录）。
十一月，福建巡抚刘汉祚奏：海寇窃踞永宁、崇武等澳，联■〈舟宗〉飘忽，屡犯洛阳内港等处；提督马得功遣参将宁献功等进剿，斩获无算（东华录）。
十六年（永历十三年、一六五九）正月，鲁王在南澳，郑成功驻沙关（海东逸史、海上见闻录）。
以徐永祯巡抚福建（清世祖实录）。
五月，郑成功迁鲁王于澎湖岛（小腆纪年在滇中命王监国后。海东逸史）。
七月，命内大臣达素为安南将军，率师征郑成功（清世祖实录）。
九月，成功自江南退师，留陈辉、阮美、罗蕴章分守舟山，于初七日回驻厦门。以出师无功，修表待罪，遣使从龙门间道达滇，自贬王爵，仍用招讨大将军印。立忠臣庙，祀死难诸臣，以甘辉为第一；哭之曰：『早从将军之言，吾不至此夫』！初，甘辉之破仙游也，闻有活阎罗王志章者能前知，斋戒往谒。志章书「位至崇明，寿至崇明」八字示之。既封崇明伯，而江南之役，道经崇明，心疑其验；阻之不获，竟死焉（小腆纪年）。
是年，调浙江水师总兵常进功为福建水师总兵，征郑成功。直抵衙前，成功兵溃，追破之于定关（贰臣传）。
十一月，满洲兵复至。十一日，头站三百人、马五百匹先至，屯东门外。途中所过，各掠三十里居住人家，令供酒肉；役使主人，拆毁房屋。大队以十二月二十六日至，屯札七门外，南至藤山、东至竹屿、北至崎山。人民住星，大屋留一进、小屋留一房与主人，仍令供给油柴酒肉。至次年四月，始往海澄。官以兵至，预征后三年粮于本色，每一两取谷六百斤，又粮每一两取白米三斗。每披甲一名，用夫至二、三十人；兼以修城，烧运砖瓦、砌石搬土，自是年冬起，每日俱用千余人（榕城纪闻）。
十七年（永历十四年、一六六○），鲁王在澎湖岛（海东逸史）。
正月，将军达素兵至福州。三月，至泉州，雇配船只。成功调回北汛诸提镇及南下兵分派屯札。四月二十六日，泉州船二百余号进至围头；成功令林察、萧拱宸等泊刘五店，遏止围头，不得入同安港会合。右虎卫陈鹏守五道、高崎东一带，援剿前镇戴捷守高崎寨，殿兵镇陈璋、前冲镇刘俊、智武镇颜望忠守澥保寨并赤山坪，游兵镇胡靖防守东渡寨，戎政王秀奇总督高崎等处，协理戎政杨朝栋总督东渡等处（海上见闻录）。
郑成功拨陈辉等泊海澄港，以截漳州大队；水师提督黄廷、周全斌等在海门迎敌。八日，漳州配大船一百号，李率泰、黄梧督之，出海澄港，将军达素、同安总镇施琅以小船配满兵渡高崎，约于十日进兵。是日，成功传令陈辉等安泊中流，不许起柁，欲待漳州船出而乘其后。倏忽间，满船乘风顺流蔽江而下，以数船攻一船，用铁链钉住，炮矢齐发，陈尧策、周瑞船及方左营皆被毁。满兵蜂拥上陈辉船，辉走入舱，发火药从下冲上，船火飞裂，满兵上船俱死，辉跳而免。成功坐熕船，继令何义督之，而下八桨船往来督战。将午，南风大发，海潮渐长，黄廷、周全斌等奋力迎战，同正副龙熕两船破■〈舟宗〉而入。龙熕受大弹子一丸至十余斤，小弹子一斗。副龙熕照样新铸者，各以一船专载之。龙熕所及，船中人顷刻不见，遂夺先锋各等船。户官郑泰自金门率船五十号乘势冲入，宣毅镇黄元从鼓浪屿后冲出夹攻，炮声如雷，隐隐不绝，火烟迷江，咫尺不辨，共擒满船十三号。满先锋三船被追至圭屿，弃船登岸；马信招之降，夜溺杀之。将军达素督兵船至牟尼屿、赤山坪登岸，陈辉挥兵于水中逆战，兵少渐不支。守高崎陈鹏密通同安施琅，谋为内应。其左营陈蟒，璋之侄也，见势急欲出兵救援，鹏止之。王秀奇总督高崎等处，速令蟒赴之。满兵见金龙甲兵，以为迎己，及下水砍杀，始慌乱。而前协万宏等继至，前冲镇刘俊亦从东冲出，协力拒战。满兵登岸皆被杀，其溺水者不计，生擒披甲三百余人，断掌放回。达素回省，吞金而死。浮尸海岸万余，长发者十二三、短发者十七八。成功磔陈鹏，杀其家属；以陈蟒为虎卫右镇、何义为虎卫左镇。自是终成功世，无敢言覆岛者（海上见闻录、小腆纪年、清史纪事本末）。
七月，成功命兵官张光启往日本国借兵船，载黄蘗寺僧隐元及其徒五十众。时日本敦请隐元，故载与俱。成功书止与国王而不及上将军主国政者，故日本兵不发（海上见闻录）。
福建总督李率泰奏：海氛未靖，应迁同安之排头、海澄之方田沿海居民入十八堡及海澄内地，酌量安插。从之（东华录、皇朝年表）。
命靖南王耿继茂移驻福建（东华录）。
命都统宗室罗托为安南将军，率师征郑成功（清世祖实录）。
八月，成功令陈尧策等札琅崎，攻连江马鼻及透堡，焚掠不遗；令杨富札福清、黄元札长乐沿海，联络征饷（海上录）。
是年，耿继茂由广东入闽镇守（福州府志、皇朝年表）。
十八年（永历一五年、一六六一），鲁王在澎湖岛（海东逸史）。
三月，授浙江提督田雄二等侯、福建提督马得功三等侯（东华录）。
郑成功进兵台湾。台湾，海外一巨岛，东倚层峦，西迫巨浸；北之鸡笼城，与福州对峙，南则河沙矶（亦作沙马碕），小琉球近焉。广袤千里，物产之利无所不有。内地自鹭门、金门迤逦以达澎湖，风涛喷蒲，瞬息万状。又东，鹿耳门旁夹七鲲身，海道纡折；余皆山罗礁拥，无所由入。隋大业中，虎贲将陈棱一至澎湖，东向望洋而返。宋史谓澎湖东有毗舍那国，即其地也。元置巡司于澎湖，明初废之。嘉靖中，海贼林道干遁入台湾，都督俞大猷追之，哨鹿耳门外以归。道干寻为琉球所逐。天启中，日本逐琉球而踞之。海澄人颜思齐者，谋夺日本计泄，与其党杨天生、陈衷纪等二十八人窜台湾，郑芝龙附焉。思齐死，芝龙领其众，寻就抚。荷兰红毛夷遭风泊台湾，乞于日本，以台湾为互市地；不许。则曰：『愿得地如牛皮，多金不惜』。许之。乃翦皮为丝，圈城里许，入居之；旋逐日本而有之。崇祯中，闽地大旱，芝龙请于巡抚熊文灿，以舶徙饥民数万至台湾，人给三金、一牛，使垦岛荒。已而芝龙去台湾，荷兰专治市舶，不敛田赋；故荷兰人二千踞城中，流民数万屯城外，相安无事。鸿荒甫辟，土膏坟盈，一岁三熟，漳州之人赴之如归。市久之，荷兰筑城曰台湾、曰鸡笼、曰淡水（一作先筑安平城，旋筑赤嵌城）。筑炮台，沈夹板于鹿耳门之港口，置揆一王守之。成功以厦门地蹙军孤，谋拓土。有荷兰甲■〈亻累〉（通事）何斌者，南安人；为揆一王主会计，负帑二十万。惧发觉，遣其私人郭平驾小舟伪为钓鱼者，顺鹿耳门至赤嵌城往来探视，得一港路，走厦门谒成功（见闻录作揆一王遣来议贡）曰：『台湾，公家之故土也；沃野千里，鸡笼、淡水硝磺有焉。横绝天海，肆通外国。耕种可以足食，兴贩铜铁可以足用，霸王之区也』。成功览其地图，叹曰：『此亦海外之扶余也』！集僚佐议之不决，惟马信、杨朝栋然之。乃令洪旭、黄廷、王秀奇辅世子经监守思明州，郑泰居金门所。成功陈兵自镇南关起，依山布阵，甲兵数万。周全斌统辖戎旗兵七千，皆衣金龙甲，军威甚盛。三月一日，祭江，督文武官亲军武卫周全斌、何义、陈蟒、提督马信、镇将杨祖、萧拱宸、陈泽、吴豪、林瑞、张志等首程先行；令澎湖游击洪暄引港，各船俱到料罗湾听令。二十二日，自料罗湾放洋。二十四日，到澎湖，分各屿住扎，成功扎营内屿（海上见闻录、小腆纪年）。
四月，成功复奉鲁王居金门（海东逸史）。
初，三月二十七日，成功自澎湖开船；下令曰：「视吾鹢首所向」。四月一日天明，成功至台湾外沙线，各船络绎至鹿耳门线外。此港甚浅，大船从无出入，故荷兰不防之。成功焚香祝曰：『成功受先帝眷顾，寸土未得，孤岛危居；今冒波涛，辟不服之区。天如佑我，假我潮水，行我舟师』。竹篙视之，则加涨丈余；以手加额曰：『此天所以哀孤而不委之壑也』！令何斌坐斗头，按图转舵。成功下小船，由鹿耳门登岸。午后，大船齐进，泊禾寮港，登岸扎营；令陈泽扎鹿耳门，牵制荷兰船，并防北线尾。守赤嵌城酋长猫鸡实叮发炮击营盘，成功恐焚及赤嵌卫，令杨朝栋督张志兵防御看守。三日，陈泽扎营北线尾，守台湾城揆一王遣头目拔鬼仔率兵数百前来冲击。陈泽迎战，一鼓歼之。四日，杨朝栋招谕赤嵌城酋长，猫鸡实叮以城孤救乏，遂率三百余名出降。令赤嵌酋长招揆一降，不从。先数夕，风潮骤振，声震云霄；揆一王率诸酋登城望海，见一人幞头红衣，骑长鲸从鹿耳门游漾纡回绕赤嵌城而没。是日，炮声轰天，以千里镜视之，见鹿耳门船只旌旗；笑谓唐船近炮台，则无遗类。俄见小船树旗纛，倏北倏东，余船以次衔尾鱼贯，悉远炮台而行，骇为兵自天降。呼酋长黎英三集众截击，仓卒间见大队已达赤嵌矣。时荷兰尚有甲版船在港，陈泽等攻之，沉其一、毁其一，余遂走。成功移师鲲身；次日，荷兰击鼓吹笛，出兵七鲲身。成功部将杨祥领藤牌手跳舞横冲，荷兰兵大败，退守王城；攻之不克，多损伤，乃斩竹为籧篨，设门户、筑土台，驾炮攻台湾城。揆一王于附城齐放大炮，顷刻土台崩，兵退。荷兰人出城夺炮，马信、刘国轩率弓箭手射之，乃退。成功令赤嵌降酋驾炮击附城，崩之。令马信等扎台湾卫固守不攻，候其自降；派各镇分汛地屯垦。改赤嵌为东都，设一府、二县。以府为承天府，委杨朝栋为府尹。一为天兴县，委庄文烈知县事；一为万年县，委祝敬知县事（海上见闻录、小腆纪年）。
荷兰夹板至，成功调右武卫前协黄德帮守台湾卫，名其卫为安平镇（海上见闻录）。
成功击台湾土番，平之。营将杨高凌削土番，大肚番阿德狗让杀高反。成功令杨祖征之，中标枪死，其锋益炽，将出援荷兰。黄安设伏诱之，斩阿德狗让，余党悉平（小腆纪年）。
安南将军内大臣达素奏：黄梧招抚郑芝龙属下伪都督万仪、万禄等，擒伪忠匡伯张进（据海上见闻录，进系自焚死）、伪总兵朱受，折毁所据铜山城垣房屋，降伪官一百八员、兵四千四百名、家口万余（东华录）。
是月，靖南王耿继茂至，随带有千副披甲。城中夜间行劫查拏，皆王府兵丁。王府取■〈金〈白上廾下〉刂〉草夫，闽、侯两县共一千三百名，长日不辍。各村供柴炭、鸡、鹅、鸭等项不绝，近郊菜园皆王人租朴，即令栽种。当铺、牙行、盐商诸色买卖，王人共分抽税，谓之「总牙」。南台，洪塘各处市镇，关隘所在，悉系王人总管。王和尚千余人、师尼五百人各住寺庵。各处渡船系王人撑载，不许渔翁取利。王母曰「太妈」者另开府于旧郎将军府，所用人夫工匠，一一如王之数（榕城纪闻）。
十月，弃降将郑芝龙于市。郑芝龙为其家人尹文器出首通海，时圣祖初登极，四辅苏克萨与郑芝龙有隙，以十月三日戮芝龙并其子孙家属凡十一人。报至，成功叱为妄传；然中夜悲哭，居常郁悒。郑芝豹以当成功变时即投诚来归，并其子俱免死（东华录）。
十二月，守台湾城揆一王降。时安平陷重围者已九月，兵士死者数千，而城坚守不下。成功乃使人告之曰：『此地乃先人故物，今我所欲得者土地耳，余悉以归汝』。揆一知不能敌，乃请降；而迁其辎重下船，率五百余人驾夹版去。成功遂有台湾，改名东宁。以各社田土分与水陆诸提镇，挈其家属至东都居住；兵丁俱令屯垦。内则组织政府，兴农业、修兵备、定法制、建学校；用处士陈永华言，筑馆舍以居明宗室遗臣之渡海者。外则置兵金门、厦门两岛，与相犄角；复通聘斐律宾群岛及西班牙诸国，以结外援。惟初至，水土不服，疫疠大作，病者十之七八，死者甚多。加以用法严峻，果于诛杀：府尹杨朝栋以其用小斗散粮，杀其一家；又杀万年县祝敬，家属发配。于是人心惶惧，诸将解体。先是，达素兵至，成功令思明州将领各眷口移住金门；其先来降者，家属乘隙多内渡。左提督王秀奇逃江南，埋名不出。原任漳州知府房星华逃入京，使其弟候补通判房星耀上言，以为海兵皆沿海取饷，使空其土而徙其人，禁舟不许下海，则彼无食而兵自散矣。降将黄梧亦先以为言。遂命户部尚书苏纳海至闽，迁海边居民离海三十里，庄村田宅悉皆焚弃；筑垣墙、立牌界，拨兵戍守，出界者死。自省城闽安镇始，北抵浙界之沙埕六百七十里、南抵粤界之分水关一千一百五十里，通为闽边一千八百二十里，筑寨固守，禁外出。其入海之水曰潘渡河、曰铜镜河、曰廉村河、曰洋尾河、曰大梅河、曰赤头河、曰云霄河、曰开溪河，皆断而守之。百姓失业，流离死亡者以亿万计。苏纳海归，荐施琅为水师提督，移镇海澄（海上见闻录、粤闽巡视纪略）。
是岁，明兵部尚书张煌言驻师福建之沙关。煌言闻成功师抵澎湖，遣幕客罗子木以书责之；谓『军有寸进、无尺退，今一入台，则将来两岛并不可守，是孤天下之望也』！不听。迁界令下，沿海流亡失所；煌言顿足叹曰：『弃此十万生灵而争岛夷乎』！复以书招成功，谓可乘机取闽南；不见听。乃遗书故侍郎王忠孝、都御史沈佺期、徐孚远、监军曹从龙，劝其力挽成功。既而再遣子木入台，苦口责之。成功以台湾初定，不能行；煌言乃以孤军徘徊金、厦两岛之间（小腆纪年）。
——以上录自福建通纪卷十一。